El sistema de alcantarillado actualmente en servicio fue construido bajo los criterios establecidas en los Planes Maestros de 1968 y 1985; sin embargo, y de acuerdo a lo determinado en los Estudios de Factibilidad del año 1985 los sistemas existentes no estaban actuando de acuerdo a lo planificado, pues se detectó un número exageradamente alto de conexiones ilícitas y de descargas sanitarias que vertían a colectores pluviales y viceversa.
Actualmente casi la totalidad del sistema de alcantarillado es de tipo combinado y captados al sistema de Interceptores mediante las unidades de derivación; y el transporte de las aguas residuales hacia la PTAR de Ucubamba para su tratamiento; con lo que se garantiza el servicio, se mejora las condiciones sanitarias de nuestros clientes y se preserva las bellezas naturales que tiene la ciudad de Cuenca y el resto de parroquias del Cantón, como son sus ríos y quebradas.